南通大学是江苏省人民政府和交通运输部共建的综合性大学。2004年，由原南通医学院、南通工学院、南通师范学院三校合并组建。南通大学现为一所规模结构合理、学科门类齐全、教学质量优秀、办学效益明显的地方综合性大学。
学校有4个校区，23个学院、1个独立学院和1所大型综合三级甲等附属医院，设有100个本科专业，涵盖文学、理学、工学、医学、艺术学、经济学、法学、教育学、历史学、管理学等10个学科门类。2007年以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估。学校拥有国家特色专业、教育部第一批本科专业综合改革试点、江苏省品牌专业、江苏省特色专业、江苏省重点专业（类），以及国家级教学团队、国家级教学成果奖、国家精品课程、国家精品资源共享课、国家精品教材、国家级实验教学示范中心、国家级虚拟仿真实验教学中心、国家级大学生校外实践教育基地等一大批优质教学资源。学校是江苏省首批教学工作先进高校、首批创新创业示范高校。
学校是国务院批准的博士学位授予单位，现有基础医学、临床医学两个博士后流动站，基础医学、临床医学、信息与通信工程3个一级学科博士学位授权点，16个一级学科硕士学位授权点，5个硕士专业学位授权点。2个学科进入ESI学科全球排名前1%。拥有省高校国家重点学科培育建设点、江苏省重点学科、江苏省高校优势学科、省临床医学重点专科、省高校优秀学科梯队等。
2016江苏省大学综合实力排行榜，南通大学排名18位
美国基本科学指标数据库ESI发布数据显示，南通大学临床医学、神经科学与行为学进入ESI学科全球排名前1%。
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