同样是副厅级待遇，副巡视员和二级巡视员差距还是蛮大。
一、称谓概念区别
副巡视员是2019年公务员职务与职级并行前副厅级非领导职务的统称。
职级并行前，公务员分领导职务与非领导职务两个序列管理。非领导职务在厅级以下设立，分八个等级，副巡视员是仅次于巡视员第二高的非领导职务等级，相关待遇对标副厅级领导职务。
二级巡视员是2019年公务员职级并行后新生的职级。改革后，公务员在厅级以下设立了十二个职级等级，其中厅级区分两个职级，分别是一级巡视员和二级巡视员，二级巡视员同样是职级中排名第二高的等级。二级巡视员在待遇上对应原来的副巡视员，主要由原来的副巡视员改套，或者改套后由一级调研员晋升而来。
二、管理权限区别
以前副巡视员属于非领导职务，虽然不是实职，但作为职务的一种被列入省委管理范畴，由省委组织部负责推荐、考察、任命、日常管理，属于“省管干部”。
现在的二级巡视员除了由原来的副巡视员改套而来不改变干部管理权限仍由省委组织部管理外，其他由一级调研员晋升而来的二级巡视员日常管理均交由省厅或地市，不再纳入省管干部序列，而是“厅管干部”或“市管干部”。这是副巡视员和二级巡视员比较明显的区别。
三、工作待遇区别
副巡视员和二级巡视员在管理权限上的不同自然带来很多待遇上的不同。具体主要体现在三个方面：
1、领导地位区别。以前副巡视员虽然不是领导职务，但组织上和单位无一例外都会把他当领导来对待，给予一定的分工或者协助正职、其他副职分管某项工作，直接领导下面的处长，听取处长汇报，处长也会给予足够的遵尊重。现在的二巡本质上是中层干部，不能领导、指挥处长，也不会分管处室，反过来理论上按规定还要接受处长指挥。
2、工作权限区别。以前副巡视员作为非领导职务，一般都会列席班子会议，享受发言、决策、阅文等权力，对外，副巡视员可以代表单位行使相应职责。现在二级巡视员除特别邀请外，不能参加班子会，也不享受班子成员待遇的阅文、决策等权力，对外更不能以单位领导自居。
3、后勤保障区别。工作用房方面，以前副巡视员享受副厅级领导用房待遇，现在二巡不行，只能按处长来对待；差旅待遇方面，以前副巡可以享受班子成员公务用车、差旅报销等保障，现在二巡除了差旅报销可以按照副厅来处理外，其他厅级领导有的待遇一概不能享受。
四、岗位职数区别
按照综合管理类公务员非领导职务设置管理办法，以前的非领导职务以一定比例核定，原则上领导职务和非领导职务总体职数不得超过三分之一。副巡视员的职数因此相当有限。现在的一二级巡视员也有比例限制，到整体比例要高于以前，职数自然也比以前多。
此外，以前的副巡视员都由实职处长或者调研员晋升，晋升时间实职处长是三年，调研员要求四年；现在二巡唯一的途径是从一级调研员晋升，不能越级，且年限统一是四年，晋升程序和要求要复杂一些
副巡视员是省管干部，二级巡视员不一定是省管干部，也许就是市管干部。
职务与职级并行规定出台之后，正处级干部虽然不能提拔为副厅级领导，但在职级上可以晋升到二级巡视员，享受副厅待遇，这对于那些正处实职领导是一个最大的利好政策。以地级市为例。
副巡视员与二级巡视员有何差别？
1、干部管理权限不同。副巡视员是职务与职级并行之前副厅级干部的称呼，它是实打实的省管干部。一个地级市，那些退居二线的副市长、人大副主任，政协副主席等厅级领导退路二线后不再任实职，改任副巡视员，是副厅级非领导干部。
职务与职级并行规定出台以后，二级巡视员有可能是副厅级干部，也有可能是正处实职领导。
地级市副厅级领导，如果提拔不到正厅或职级晋升到一级巡视员，它对应的就是二级巡视员，同属于省管干部，跟之前的副巡视员是同一级别的，管理权限仍在省委组织部。
由正处实职领导晋升为二级巡视员的领导干部，管理权限还在市委组织部，仍然是处级领导干部。有一种特殊情况是，县委书记、县长本来就是省管干部，在位子上晋升到二级巡视员管理权限不变。这跟其他市管干部晋升二级巡视员还是有差别。
2、工资待遇的差别。职务与职级并行后，副巡视员套改为二级巡视员，其实在经济待遇上跟正处级领导干部晋升的二级巡视员待遇是一样的，都是享受副厅待遇。
3、政治待遇上的差别。由副巡视员套改为二级巡视员的副厅级领导，没有改变其副厅级领导的身份，如果是退居二线的副市长，职级对应二级巡视员，根据市政府领导分工，可以协管部分工作，通过授权主持召开相关会议，夸部门协调工作，还有部分阅文权。由正处实职领导晋升的二级巡视员，只有岗位职权，还不是市级干部，不能上升到市级层面，协调不了夸部门工作，政治上差别是，一个是厅级干部，一个是享受副厅待遇的正处级干部。
总之，副巡视员是职务与职级规定出台之前的称呼，但却是实实在在的副厅级领导干部。二级巡视员如果不是副厅级领导，仅是正处级领导更高的一个职级，它的本质还是处级干部，只享受经济待遇，没有厅级干部的政治待遇。
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