“你认识自己吗？”
这个问题，听起来有点傻吧，照照镜子，谁都能认得这张再熟悉不过的脸，但更深层次呢？你认识自己吗？
当然，我们不是一个都市鸡汤号，我们暂不讨论心灵的健康与自我价值的实现……今天，我们要探索的自我，不是一个65kg的自我，或一个165cm、178cm的自我，而是一个枯燥但神秘、容量3个G的“自我”。
前些年，有一家叫做23 and me的公司在国外特别火，只要将你的一口唾沫和99美元寄给这家公司，你就能知道自己祖先的起源：纯正的汉族？五代以上有蒙古先人？奇妙的0.1%欧洲血统？……
不过，这种检测更多是为了有趣，真正“有关23”的检测可比这要复杂得多得多得多，接下来，就让我们一起来烧烧脑，了解一下基因检测的进阶版：
全外显子组测序
全外显子组测序，是什么？
我们知道，正常人有23对（46条）染色体，一半来自父亲，一半来自母亲。而基因就是这些染色体上的一段序列。科学家发现，全部人类基因组约有39000多个基因，大小约为3个G。
基因由外显子和内含子组成。外显子和内含子是由A、T、C、G4种碱基组成的DNA序列。外显子部分的序列主要参与蛋白质的编码，而蛋白质是执行生理功能的重要分子。因此，外显子序列的突变参与疾病的可能性更大，也具有重要意义。
全外显子组测序就是选择性地捕获并检测了外显子部分的序列。测序获得的原始碱基序列并不能直接与疾病挂钩。这些枯燥繁复的ATCG需要通过后期一系列的生物信息学分析、比对、注释，才能成为一份“全外”报告，整个过程需要耗费很长的时间。
在浙二神经内科，为了进一步明确诊断，不少患者会被医生建议进行基因检测。当拿到检测结果的时候，大家常常会困惑报告看不懂，不知从何下手。那么，我们就从一份真实报告着手，好好看看这份“揭露真我”的报告，究竟讲了什么？
样本与检测信息
这部分比较简单，主要记录了检测对象的基本信息。并告诉我们检测的项目和方法（全外显子组测序）。患者收到报告后可以核对信息是否正确。
主要检测结果
敲黑板，这部分很重要！全外显子组共检测人类的25000多个基因。在和标准基因组序列比对后，我们会发现每个人都携带了成千上万的变异。
但并不是只要有变异就是有害的，也不是所有的变异都和疾病有关。这里的检测结果是遗传分析人员经过大量筛选分析后，挑选出来和患者的临床表现较为相关的几个基因。还需要强调的是，判定一个变异的致病性需要临床医生结合患者的表现具体分析，列在这里的基因并不一定就是致病基因，采集家属的血样进行检测，作为分析的对照也很重要。
01
基因 / 转录本
基因：即基因的名字，如“SCN1A”
转录本：在这个报告里，是“NM_006920.4”。转录本是比较专业的名词，通俗地说，DNA产生mRNA（信使RNA），然后在合成蛋白质时，mRNA就是合成的模板，通过它来翻译出蛋白质。转录本就是一个mRNA的“身份证”。根据这个编号，专业人员就能知道对应的是哪个mRNA。
基因的转录与翻译，感兴趣的可以看看哦。
02
“基因亚区”和“突变信息”
主要为了说明突变的具体位置。具体的就交给专业人员看吧。
03
“突变类型”和“遗传方式”
隐性遗传？显性遗传？杂合突变？……
这些名词是不是“好像有听过，但并不记得是什么意思？”那接下来，就是高中生物的补习时间：
常染色体隐性遗传（AR）：致病基因位于常染色体上，基因性状为隐性，需要两条染色体均发生突变才会致病。
常染色体显性遗传（AD）：致病基因在常染色体上，基因性状为显性，只需要1条染色体上携带突变就会致病。
04
致病性分类
致病性分类是根据美国医学遗传学和基因组组学学院制定的指南来分级的。共有5个等级：
致病的（pathogenic）
可能致病的（likely pathogenic）
临床意义未明确的（VUS）
可能良性的（likely benign）
良性的（benign）
对变异进行致病等级的划分可以帮助医生和患者了解这个变异与疾病是否相关。
在报告中，前三类较为常见，如果看到致病的，或者可能致病的，那很有可能是找到了致病基因，但仍需有经验的临床医生进一步评估。这个等级的划分是软件根据指南自动打分给出的结果，是可以变化的。如果后续增加新的证据，如通过家属血液样本检测给出的证据，突变的致病等级就需要临床医生根据指南再评估。
05
疾病 / 表型
即对应的基因会导致的疾病名称，该疾病具体的临床表现在“结果说明”栏目可以看到。
06
RS号
RS号：这是科学家给已发现的单核苷酸变异（SNP）的一个身份标识。遗传分析人员可以通过RS号在数据库里查询关于该变异的更多信息。
文献：可以提示是否已有相关的文献报道该突变位点。
结果说明
这一部分是对“主要检测结果”的进一步说明，如突变位点的人群频率信息。
1000Genoms数据库、ExAC数据库、gnomAD数据库都是常用的人群数据库，如果突变位点在人群中的频率高于5%，则可作为良性变异的独立证据。反之，在人群中突变频率越低则有害的可能性越大。
SIFT软件、Polyphen-2软件、MutationTaster软件等错义突变软件，可根据错义突变影响蛋白的结构、保守性等预测突变位点对蛋白功能的破坏作用。软件的预测可以作为分析突变致病性的支持证据。Damaging意为有害的。对于基因所对应的疾病，这部分也有较为详细的描述。
附录一：检测基因列表
这里密密麻麻的，列的是本次全外检测的基因。
附录二：测序数据质控
这部分用以说明本次测序的质量。目标区域覆盖度能达到99%以上是测序质量合格的一个指标。
附录三：一代测序验证
全外显子组测序是二代测序，测序准确性较高，假阳性率大约为0.01%。为了保证结果的可靠性，我们会对怀疑的突变进行sanger测序，以验证突变的真实性。
全外显子组测序的局限性
任何检测方法都有自身的优势和局限性，全外显子测序也不例外。
常常有患者问：做了全外显子检测是不是把和遗传相关的病因都查了？
全外显子组测序确实相对全面，囊括了非常多的基因，主要筛查的是基因的点突变和小的插入缺失突变。但由于遗传突变的复杂性，也难免有漏网之鱼，如大片段的缺失重复，动态突变等等。这些需要临床医生结合患者的病情，在有需要的情况下，运用其他的检测手段来发现。
数据分析
这部分给出了获得原始测序数据以后，数据分析的流程。内容比较专业，感兴趣的朋友可以自己了解。
文献
如果发现的突变已有相关文献报道，则会在下面列出相关文献。但文献更新较快，可能存在已有文献报道但尚未写入报告的情况。
怎么样，看到这里，你对基因报告是不是有更多了解了？读读浙二公众号，是不是又找回了当年学习的感觉？每天看一篇，学霸小明星就是你哦！
《医生教你读报告》系列
第一期：医生，这报告单上的一串英文啥意思？是说我得癌了吗？？！
看完这个系列，没准你也能当个“家庭医生”了呢！
吴志英
浙大二院副院长，神经病学研究中心主任，神经内科主任医师、博士生导师。国家杰出青年基金获得者，新世纪百千万人才工程国家级人选，国务院政府特殊津贴专家。长期从事神经内科的临床、教学和科研工作，擅长神经遗传病和运动障碍病等罕见病的诊治，并采用遗传和分子技术寻找疾病的致病基因，研究其发病机制并优化治疗方案。
门诊时间：周二上午（国际医学中心），周五上午（解放路院区名医馆）
（原标题《你多大呢？28？35？还是47？今天我们要讨论的你，却永远是3个G那么大……》。编辑王蓉蓉）
原创文章，作者：芒小种，如若转载，请注明出处：http://www.fhgg.net/shenghuobaike/65161.html
本文来自投稿，不代表【食趣网】立场，如若转载，请注明出处：http://www.fhgg.net/
